Single-cell Analysis

Scale Bioscience는 2020년에 California주 San Diego에 설립되어 연구자들에게 장비가 필요없는 single-cell analysis solution을 제공합니다.

 

특허 등록된 massively parallelized barcoding 기술을 바탕으로, 최대한 저렴한 가격으로 많은 양의 샘플과 세포를 분석 가능하게 하며, scRNA sequencing뿐 아니라, single cell 단위의 methylation sequencing, ATAC sequencing, 그리고 CRISPR screening도 가능하게 합니다.

 

별도의 프랩 장비가 필요하지 않다는 점에서 더욱 저렴한 비용으로 분석이 가능하며, cell type에 구애를 받지 않는점을 바탕으로 그 동안 single-cell 분석에 진입장벽이 있었던 연구자들에게 해결책을 제시합니다. 더 나아가, Scale Bio만의 폭넓은 어플리케이션으로 single-cell RNA sequencing에 국한되어 있던 연구들의 한계를 넓힙니다.

Single cell transcriptomics

Messenger RNA (mRNA)는 세포의 타입과 역할군을 연구하는데 중요한 역할을 합니다. Scale Bio의 키트로 각 세포의 mRNA를 별개 분석하여 각 cell type 분석, 약물과 같은 외부 요소에 대한 반응, 그리고 rare 하거나 novel한 타입의 세포를 찾아낼 수 있습니다.

 

– 분석 가능 분야:

    • Cell Atlases
    • Drug Screening
    • Disease Mechanisms
    • Cancer biology

Single cell epigenomics

DNA Methylation에 의한 DNA binding proteins, 그리고 gene expression regulation은 세포의 구분 밝혀내는 연구에 필수적입니다. 또한 Assay for Transposase-Accessible Chromatin (ATAC-seq) 기술은 열린 chromatin 구간을 분석하여 관련된 active promoter와 enhancer연구에 도움을 줍니다. 업계에서 유일하게 Scale Bio의 Single Cell Methylation kit만이 single cell 단위의 methylation 분석 솔루션을 제공합니다.

 

– 분석 가능 분야:

  • Biomarker discovery
  • Tumor heterogeneity
  • Neuronal diversity
  • Aging and molecular clocks

Functional genomics & perturbomics

CRISPR screening은 기존 유전자의 기능을 더 구조적이고 세밀하게 연구할 수 있도록 해주며, 편집된 유전자를 바탕으로 Single cell 단위의 전사체 발현 차이와 생물학적 동요 (perturbation) 정보를 분석할 수 있습니다. Scale Bio에서 제시하는 single-cell CRISPR screening기술력으로 더욱 세밀하고 광범위한 연구를 진행해 보시길 바랍니다. 

– 분석 가능 분야:

    • Pooled CRISPR screening